L’ augmentation des nutriments dans les cours d’eau conduit dans de nombreux cas à une eutrophisation accentuée des milieux. Ce processus complexe affecte tous les compartiments de l’écosystème : perturbations physiques, chimiques et biologiques des eaux, et au-delà, la valeur d’usage des milieux aquatiques.
Par leur fonctionnement, les hydrosystèmes contribuent à la régulation de divers processus écologiques, qu’ils soient physiques (stockage d’eau dans les plaines d’inondation, recharge des aquifères et soutien d’étiage des cours d’eau par les zones humides), chimiques, ou encore biologiques.
Depuis quelques années, les recherches scientifiques concernant les relations entre hydromorphologie et processus de transformation des nutriments se développent. Cette synthèse bibliographique fait un point, illustré par quelques exemples, sur les éléments à retenir de l’état des connaissances actuelles.